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中科光析科學(xué)技術(shù)研究所
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發(fā)布時(shí)間:2025-09-18
關(guān)鍵詞:三代高通量測序測試周期,三代高通量測序測試案例,三代高通量測序測試范圍
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來源:北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所
因業(yè)務(wù)調(diào)整,部分個(gè)人測試暫不接受委托,望見諒。
測序準(zhǔn)確性檢測:評估測序 reads 中堿基 calling 的準(zhǔn)確程度,通過比對參考基因組計(jì)算匹配率,確保數(shù)據(jù)可靠性,避免誤判影響下游分析。
讀長分布檢測:分析測序產(chǎn)生的 reads 長度分布情況,統(tǒng)計(jì)平均讀長和標(biāo)準(zhǔn)差,用于評估測序系統(tǒng)性能和數(shù)據(jù)適用性。
錯(cuò)誤率檢測:計(jì)算測序過程中堿基錯(cuò)誤發(fā)生的頻率,包括插入、缺失和替換錯(cuò)誤,確保錯(cuò)誤率在可接受范圍內(nèi)。
GC bias 檢測:檢查測序數(shù)據(jù)是否受 GC 含量影響,評估不同 GC 區(qū)域覆蓋均勻性,防止 bias 導(dǎo)致數(shù)據(jù)偏差。
覆蓋均勻性檢測:評估基因組各區(qū)域測序覆蓋的均勻程度,計(jì)算覆蓋深度變異系數(shù),確保無顯著覆蓋盲區(qū)。
插入片段大小檢測:測量文庫中 DNA 插入片段的大小分布,用于優(yōu)化文庫質(zhì)量和測序效率。
接頭污染檢測:檢查測序數(shù)據(jù)中是否存在 adapter 序列污染,評估污染比例,確保數(shù)據(jù)純凈性。
重復(fù)率檢測:計(jì)算測序 reads 中 duplicates 的比例,評估文庫復(fù)雜性和測序效率,避免過度測序。
質(zhì)量值分布檢測:分析測序 reads 的質(zhì)量值分布情況,評估數(shù)據(jù)整體質(zhì)量水平,確保高質(zhì)量數(shù)據(jù)輸出。
變異檢測準(zhǔn)確性檢測:評估測序數(shù)據(jù)在變異 calling 中的準(zhǔn)確性,通過已知變異集驗(yàn)證敏感性和特異性。
人類基因組測序:應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷,檢測全基因組或外顯子組變異,支持疾病機(jī)制研究和個(gè)性化醫(yī)療。
微生物基因組測序:用于病原體檢測和環(huán)境微生物研究,鑒定物種和功能基因,支持公共衛(wèi)生和生態(tài)研究。
植物基因組測序:應(yīng)用于農(nóng)業(yè)育種和植物學(xué)研究,檢測基因變異和表達(dá),提高作物抗性和產(chǎn)量。
動(dòng)物基因組測序:用于畜牧業(yè)和野生動(dòng)物保護(hù),分析遺傳多樣性和進(jìn)化,支持物種管理和保護(hù)。
轉(zhuǎn)錄組測序:用于基因表達(dá)分析,檢測 RNA 序列和表達(dá)量,研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控和功能。
宏基因組測序:應(yīng)用于環(huán)境樣本中的微生物群落分析,鑒定物種組成和代謝途徑,支持生態(tài)和健康研究。
表觀基因組測序:如 DNA 甲基化測序,檢測表觀遺傳修飾,研究基因調(diào)控和疾病機(jī)制。
單細(xì)胞測序:用于細(xì)胞異質(zhì)性研究,分析單個(gè)細(xì)胞基因組或轉(zhuǎn)錄組,支持發(fā)育和癌癥研究。
長讀長測序應(yīng)用:如結(jié)構(gòu)變異檢測,利用長 reads 解析復(fù)雜基因組區(qū)域,提高變異檢測準(zhǔn)確性。
臨床樣本測序:如腫瘤樣本測序,檢測 somatic 變異和融合基因,支持癌癥診斷和治療。
ISO 20395:2019 Biotechnology — Requirements for evaluating the performance of sequencing systems:國際標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了測序系統(tǒng)性能評估的要求,包括準(zhǔn)確性、敏感性和特異性測試方法。
ASTM E3030-2016 Standard Guide for Validation of Nucleic Acid Sequencing Systems:美國材料與試驗(yàn)協(xié)會(huì)標(biāo)準(zhǔn),提供測序系統(tǒng)驗(yàn)證的指南,涵蓋數(shù)據(jù)質(zhì)量和分析流程。
GB/T 30988-2014 高通量測序數(shù)據(jù)格式規(guī)范:中國國家標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了高通量測序數(shù)據(jù)的格式和存儲(chǔ)要求,確保數(shù)據(jù)交換和共享的一致性。
ISO 20184-1:2018 Molecular in vitro diagnostic examinations — Specifications for pre-examination processes for frozen tissue:國際標(biāo)準(zhǔn)涉及樣本前處理要求,適用于測序樣本制備和質(zhì)量控制。
GB/T 37872-2019 生物樣本庫質(zhì)量和能力通用要求:中國國家標(biāo)準(zhǔn)涵蓋生物樣本管理,確保測序樣本質(zhì)量和 traceability。
高通量測序系統(tǒng):采用長讀長技術(shù)產(chǎn)生序列數(shù)據(jù),具備實(shí)時(shí)測序和堿基 calling 功能,用于生成原始測序 reads。
核酸提取儀:自動(dòng)化提取 DNA 或 RNA 從各種樣本類型,確保高純度和產(chǎn)量,為測序提供高質(zhì)量模板。
文庫構(gòu)建儀:自動(dòng)化制備測序文庫,包括片段化、末端修復(fù)和 adapter 連接,優(yōu)化文庫復(fù)雜性和一致性。
熒光光度計(jì):測量核酸濃度和純度,通過熒光染料檢測,確保樣本質(zhì)量符合測序要求。
電泳系統(tǒng):分析 DNA 片段大小分布和質(zhì)量,評估文庫完整性,防止 adapter 污染或降解
銷售報(bào)告:出具正規(guī)第三方檢測報(bào)告讓客戶更加信賴自己的產(chǎn)品質(zhì)量,讓自己的產(chǎn)品更具有說服力。
研發(fā)使用:擁有優(yōu)秀的檢測工程師和先進(jìn)的測試設(shè)備,可降低了研發(fā)成本,節(jié)約時(shí)間。
司法服務(wù):協(xié)助相關(guān)部門檢測產(chǎn)品,進(jìn)行科研實(shí)驗(yàn),為相關(guān)部門提供科學(xué)、公正、準(zhǔn)確的檢測數(shù)據(jù)。
大學(xué)論文:科研數(shù)據(jù)使用。
投標(biāo):檢測周期短,同時(shí)所花費(fèi)的費(fèi)用較低。
準(zhǔn)確性高;工業(yè)問題診斷:較約定時(shí)間內(nèi)檢測出產(chǎn)品問題點(diǎn),以達(dá)到盡快止損的目的。